В общем у меня оказалась таки шестерня 5-й передачи - та, что больше по диаметру, не знаю, ведомая или ведущая. В ней была выработка в месте, куда шплинт (или как правильно) вставляется, вот она там и гуляла себе. К тому же на обеих шестернях, по сравнению с теми, что я взял (б/у в идеале у Турка), зубья острее были. Заменили, вибрация и гул пропали. Масла залили почти 3 литра - как тут рекомендовали, надо заливать больше, чем в книжке написано, шоб 5-я смазывалась.
Был один нюанс - когда собрали, машина была как будто со включённой передачей, т. е. заводишь, а она вперёд дрыгается, к тому же очень тяжело втыкались 2, 4 и 5 передачи. Туда-сюда машину потолкали, и всё прошло, теперь я коробку вообще не слышу
З. Ы. Машине пробег под 150 тыщ, и это я впервые залез в коробку. До этого максимум, что делал - менял трос сцепления.